雅科夫列夫回到莫斯科厉，继续研制歼击机，1940 年 1 月 1 日，歼击机 “伊—26”（即“雅克-1”）被制造出来，并试飞成功。同时，“米格”、 “拉格”也相继研制成功，并通过了试飞，这三种飞机同于 1940 年 5-6 月投 入批量生产。

伊尔型、彼型、米格型、拉格型及雅克型飞机的研制和生产成功，不仅意味着苏联空军由于有了现代化的歼击机、强击机和轰炸机而使它面貌一新，而且，更意味着造就了一批富有创造性的、生气勃勃的年轻设计师。 1940 年 1 月，雅科夫列夫被任命为苏联航空工业人民委员部副人民委员，负责航空科研和试制工作。此时，雅科夫列夫年仅 33 岁，他将副人民委 员的职务与设计飞机的创造性工作结合起来，通常他是上午在设计局和工厂 进行飞机设计工作，下午直到凌晨两三点都在航空工业人民委员部工作。雅科夫列夫在航空工业人民委员部的工作，是从挑选由他管辖的飞机研制总局的领导干部开始，对这个总局重新组织和充实，并且在较短的时间内就顺利地从空军的著名工程师中挑选吸收了一些工作能力很强的工作人员充实到总局，他们都是该专业著名的技术专家。各处的处长也大都由工程技术勤务将军担任。其次，任命空军将领伊万•费多罗维奇•彼得罗夫为中央空气流体动力学研究院的院长。伊•费•彼得罗夫在航空方面具有丰富的实际工作经验和扎实的工程技术知识，他为了使研究院的科研人员接触航空实践，组织该院一些大科学家学习飞行，他认为不进行实地飞行，不了解飞机如何驾驶，就不能研制出新型飞机。因此，许多科学家、教授都学会了自己开飞机，这样有利于改造旧飞机，试制新飞机。

为了规范各飞机设计局的工作条例，雅科夫列夫组织编写了《设计师手册》。这是设计师的准则，它阐述了现代飞行设计、制造和试验的基本原则；统一了试验程序等。这部《设计师手册》的各部分都是由苏联国内最著名的科学家编写的，把当时航空科学的最新成就都写了进去，是一部内容非常丰富的百科全书。它在整顿各设计局的工作时起到了十分良好的作用，也是沟通科研与生产实践极为重要的渠道。